基础医学院举办龙星计划《生物信息学》课程
2019年7月29日至8月2日,由北京大学基础医学院医学生物信息学系和北京大学生物信息中心联合举办的2019年龙星计划《生物信息学》课程在北京大学医学部逸夫楼顺利举行。来自全国各地近120家单位以及美国康奈尔大学、美国纽约州立大学、加拿大布鲁克大学和沙特阿拉伯阿卜杜拉国王科技大学等4家海外大学的共298名学员参加了课程学习。本次《生物信息学》课程是北大医学首次举办龙星计划课程,课程的举办有助于医学部医学生物信息学教育质量的提高,促进了本部与医学部在生物信息学科的进一步融合,也增进了外单位学员对北大医学的了解。
本次课程以“医学基因组学的方法与实践”为主题,涵盖高通量测序和基因芯片的技术原理、短读长与长读长的序列对比、基于测序数据的基因组组装、人类外显子组测序和全基因组测序的分析方法、单碱基突变与结构变异的注释解读、单基因疾病的个体遗传诊断、基于人群数据的复杂疾病致病基因寻找,以及整合多种组学技术鉴别致病基因等内容。课程主讲老师王凯现任宾夕法尼亚大学病理系副教授、费城儿童医院细胞与分子治疗中心研究员。王凯老师长期从事用于高通量基因组数据深度挖掘的医学生物信息学计算分析工具开发,并利用功能基因组学方法探究人类遗传性疾病的致病基因与致病机理。
在为期5天的课程中,上午由王凯老师讲解理论知识,下午由王凯老师以及来自北京大学、同济大学、中国科学院、军事科学院等单位的14名助教协助学员在“中软国际·华为云”提供的云服务器上进行上机实践。通过理论学习与上机实践相结合,学员们加深了对人类基因组学基本知识的理解,初步掌握了寻找疾病基因的生信方法及软件使用。学员们普遍对本次龙星课程的授课质量与服务保障给予高度评价。
课程的组织实施受到了北京大学基础医学院的高度重视和大力支持。研究生院医学部分院、医学部教室管理服务中心、医用理学系计算机教研室、医学继续教育学院、国际合作处、保卫处、信息通讯中心等多个部门为课程能够在暑期顺利进行提供了巨大的帮助。理论授课视频与相关实习资料将于近期在中国医药学研究生在线教育平台(http://www.cmgemooc.com)发布。
延伸阅读:
龙星计划是由中国计算机学会发起的公益性计划。该计划通过组织在美国学术界拥有较高学术声望的华人教授,回国系统地讲授一门美国研究生课程(每门课程15~30课时)。以促进我国相关领域的发展。课程面向全国相关领域的教师、学生以及企业界人士,学员免费参与相关学习。2019年度的龙星计划《生物信息学》课程面向医学、生物、统计和计算机等专业的相关人员,内容侧重于医学基因组学的方法与实践。
(基础医学院)
编辑:郑凌冰